Strukturę organizacyjną Biblioteki stanowią*:
- Dyrektor;
- Oddział Gromadzenia Zbiorów Zwartych;
- Oddział Opracowania Zbiorów Zwartych;
- Oddział Gromadzenia i Opracowania Zbiorów Ciągłych;
- Oddział Czytelni;
- Oddział Udostępniania Zbiorów Ogólnych;
- Oddział Informacji Naukowej;
- Oddział Informatyzacji;
* Struktura została ustanowiona Zarządzeniem nr 9/2022 Komendanta-Rektora Wyższej Szkoły Policji w Szczytnie z dnia 27 stycznia 2022 r. w sprawie struktury i zakresu zadań oddziałów Biblioteki, z późn. zm.